Etat-fonctionnement normal d'un étang
- En fonctionnement normal, l'énergie solaire permet aux algues microscopiques et aux plantes de plus grande taille (des Macrophytes comme les nénuphars qui se développent à la surface, produisant aussi de la biomasse en émettant de l'oxygène) de se développer en surface et dans la zone éclairée (zone euphotique) et de fixer le carbone atmosphérique tout en rejetant de l ‘oxygène (c'est la production primaire à la base de toute chaîne trophique). Cet élément (l'O²) dissout dans l'eau, permet un fonctionnement harmonieux et le développement équilibré des autres organismes vivants et de leurs populations dans la couche euphotique.

Etang non eutrophe
- Lorsque le phytoplancton meurt (les micro-algues et quelques macrophytes flottantes), il est assimilé en surface par des bactéries ayant recours à l'oxygène, qui sont elles-mêmes digérées par d'autres bactéries à leur mort et ainsi de suite. C'est ce qu'on appelle la boucle microbienne.
D'autres espèces de rang trophique supérieur (le zooplancton, les insectes, crustacés, mollusques, les poissons etc.) broutent ou avalent cette « manne » dans la couche euphotique en particulier et dans la colonne d'eau.
Une partie de ces flores et faunes sédimentent pour rejoindre le fond. Ainsi une part importante des minéraux est séquestrée dans la Matière organique (MO) et évite la surconcentration de minéraux vitaux (N, P, C) qui entraîneraient l'eutrophisation de la masse d'eau.
- les sédiments ou boues sont donc, en partie, constitués des restes d'individus de niveaux trophiques différents et de MO exogènes (feuilles d'arbre situés en bordure de l'étang, excréments des animaux, cadavres d'animaux, aliments etc..), le reste étant constitué de matières minérales (argiles, sable etc.). Ces sédiments sont riches en phosphates qui sont bloqués chimiquement par la présence d'un milieu riche en oxygène donc oxydant.

Etang en fonctionnement normal
Des organismes exploitent ces « boues » en vivant à la surface ou à l'intérieur du sédiments et ingérant des MO avec des phénomènes de bioturbation (comme pour les vers de terre en milieu terrestre) et de transformation de la matière organique. Ce mélange du sédiment s'accompagne d'une aération de ce dernier qui reste dans un état oxydant.
Jusque là, notre étang est en bonne santé même si de la vase s'accumule au fond. Carla concentration en phosphore dans l'eau est faible et que le phosphore est l'élément limitant la plupart du temps (cf. en agronomie la loi de Liebig)
Le vent en particulier, par effet d'upwelling (remontée des couches d'eau inférieures grâce au vent qui induit des courants en surface se répercutant sur les couches plus profondes) mélange les couches en automne et en hiver, (cf. article sur la cipel) homogénéise et oxygène les couches d'eau. La faible température et la présence d'une biocénose fonctionnant bien, empêche l'eutrophisation

